Here you go!

Juan de Dios Valdivia and Petronila de Alva

https://www.familysearch.org/ark:/61903/3:1:9392-DVQ1-Y?i=147&wc=3JWL-K…

Pedro Valdivia(1) (son of Juan Valdivia and Petrona de Hermosillo) and Juana de Alva

https://www.familysearch.org/ark:/61903/3:1:9392-DV7Q-3?i=141&wc=3JWL-K…

BE CAREFUL: There is also another Pedro Valdivia(3) son of Pedro Valdivia(2) and Juana de Alva (I am not sure if they the same couple as Pedro Valdivia(1) and Juana Gertrudis de Alva from your post) who married 1) Anna Gonzalez de Hermosillo and 2) Cayetana Perez de Vargas

https://www.familysearch.org/ark:/61903/3:1:9392-65TQ-4?i=71&wc=3J47-C6…

The reason I say BE CAREFUL is that Pedro Valdivia(3) was married to Anna Gonzalez de Hermosillo in 1720.

https://www.familysearch.org/ark:/61903/3:1:9392-F4BH-9?i=95&wc=3JHC-GP…

Pedro Valdivia(1) was born in 1692:

https://www.familysearch.org/ark:/61903/3:1:9392-VK91-7S?i=73&wc=3JCC-C…

Therefore there is a very tight timeline to allow for the couple Pedro Valdivia(1) (son of Juan Valdivia and Petrona de Hermosillo) and Juana de Alva, to be the same couple as Pedro Valdivia(2) and Juana de Alva.

Furthermore, there is dispensa 1778 in the Sagrada Mitra book:
Cuquio. Jal. Enero 16 de 1745. Exp 20.- Dispensa de tres impedimentos, el uno de tercero grado, y los dos de cuarto grado de consanguinidad - Ignacio Antonio de Valdivia, español de 20 años de edad, originario y vecino de esta feligresía de San Phelipe de Cuquio. hijo legítimo de Don Pedro Valdivia y de Doña Ana González de Hermosillo. difunta, con Doña María Antonia González de Islas, española de 17 años de edad, originaría y vecina de esta feligresía, hija legítima de Don Miguel González de Islas y de Doña María Theresa de Alva
Bocanegra. Declaración del pretenso: Don Sebastián González de Hermosillo, mi abuelo materno, y Doña Juana González de Hermosillo, abuela materna de la pretensa, fueron hermanos, y así siguen, que Doña Ana González mi madre y Doña María Theresa de Alva, por ser hijas de las arriba mencionadas, se hallan en segundo grado igual, y por consiguiente la pretensa y yo en tercero grado igual. Don Alonso de Alva. mi bisabuelo paterno, y Don Joseph de Alva, bisabuelo materno de la pretensa, fueron hermanos, y Doña Juana de Alva, mi abuela, y Don Andrés de Alva. abuelo de la pretensa, fueron primos hermanos, y Don Pedro
Valdivia, mi padre, y Doña María Theresa de Alva, madre de la pretensa, primos segundos que es tercero grado. Y Don Nicolás Romero de Chávez, bisabuelo paternode la pretensa, y Doña María Romero de Chávez, mi bisabuela materna, fueron hermanos, y Doña María Romero, abuela paterna de la pretensa, y Doña Theresa de la Mora, mi abuela materna, se hallan en segundo grado, por ser hijas de los arriba mencionados, y Don Miguel González de Islas, padre de la pretensa, por ser hijo de Doña María Romero, y Doña Ana González de Hermosillo, mi madre es
hija de dicha Doña Theresa de la Mora, se hallan en tercero grado. Se otorgó la dispensa en la Ciudad de Guadalajara. en 29 de enero de 1745. 16 fojas.

This dispensa shows the father of Juana de Alva who married Pedro Valdivia(2) was Alonzo de Alva. This conflicts with the dispensa for Pedro Valdivia(1) and Juana de Alva at top of this post which shows her father being Pedro de Alva.

GOOD LUCK